Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vax1Q2NKI2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms