Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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Shroom4Q1W617 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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Shroom4Q1W617 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
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Shroom4Q1W617 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
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Shroom4Q1W617 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
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Shroom4Q1W617 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Shroom4Q1W617 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
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