Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300lgQ1ERP8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300lgQ1ERP8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms