Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sap25Q1EHW4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sap25Q1EHW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms