Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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ptchd1Q14B62 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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ptchd1Q14B62 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ptchd1Q14B62 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ptchd1Q14B62 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ptchd1Q14B62 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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