Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpusd2Q149F1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpusd2Q149F1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpusd2Q149F1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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