Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp2b3Q0VF55 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b3Q0VF55 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b3Q0VF55 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms