Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rundc1Q0VDN7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rundc1Q0VDN7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rundc1Q0VDN7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms