Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab42Q0PD08 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rab42Q0PD08 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms