Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TrioQ0KL02 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TrioQ0KL02 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms