Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnnm1Q0GA42 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnnm1Q0GA42 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms