Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ssrp1Q08943 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ssrp1Q08943 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms