Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxc4Q08624 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxc4Q08624 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms