Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calb2Q08331 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calb2Q08331 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms