Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnn2Q08093 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnn2Q08093 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms