Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F13bQ07968 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms