Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CluQ06890 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CluQ06890 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CluQ06890 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CluQ06890 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CluQ06890 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CluQ06890 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CluQ06890 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CluQ06890 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CluQ06890 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CluQ06890 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CluQ06890 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CluQ06890 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms