Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPINDOCQ05AH6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPINDOCQ05AH6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms