Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r236Q05A06 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r236Q05A06 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms