Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rcn1Q05186 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rcn1Q05186 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms