Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdk18Q04899 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms