Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox13Q04891 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox13Q04891 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms