Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top1Q04750 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top1Q04750 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Top1Q04750 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Top1Q04750 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms