Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CkbQ04447 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CkbQ04447 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CkbQ04447 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CkbQ04447 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms