Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnb1Q03717 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnb1Q03717 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnb1Q03717 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms