Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Epha4Q03137 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Epha4Q03137 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms