Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna1sQ02789 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cacna1sQ02789 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms