Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb5Q02739 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb5Q02739 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms