Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GscQ02591 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GscQ02591 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GscQ02591 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GscQ02591 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GscQ02591 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GscQ02591 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GscQ02591 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms