Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr1fQ02284 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr1fQ02284 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms