Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pdcd1Q02242 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd1Q02242 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd1Q02242 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd1Q02242 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd1Q02242 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd1Q02242 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd1Q02242 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd1Q02242 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd1Q02242 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pdcd1Q02242 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms