Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RykQ01887 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RykQ01887 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RykQ01887 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RykQ01887 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RykQ01887 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RykQ01887 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RykQ01887 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RykQ01887 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RykQ01887 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RykQ01887 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RykQ01887 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RykQ01887 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RykQ01887 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RykQ01887 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RykQ01887 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms