Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1cQ01815 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1cQ01815 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms