Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Top2aQ01320 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Top2aQ01320 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms