Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pde1bQ01065 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde1bQ01065 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms