Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp1Q00915 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp1Q00915 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms