Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col8a1Q00780 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col8a1Q00780 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms