Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VegfaQ00731 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VegfaQ00731 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VegfaQ00731 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms