Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga4Q00651 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga4Q00651 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms