Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfdP97946 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfdP97946 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VegfdP97946 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfdP97946 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms