Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AlkP97793 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AlkP97793 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AlkP97793 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
AlkP97793 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AlkP97793 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AlkP97793 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AlkP97793 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AlkP97793 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AlkP97793 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AlkP97793 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AlkP97793 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AlkP97793 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AlkP97793 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AlkP97793 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AlkP97793 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AlkP97793 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AlkP97793 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AlkP97793 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AlkP97793 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AlkP97793 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AlkP97793 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms