Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcc1P97496 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcc1P97496 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms