Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps3aP97351 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3aP97351 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps3aP97351 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms