Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mesp1P97309 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mesp1P97309 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms