Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ErfP70459 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ErfP70459 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ErfP70459 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ErfP70459 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ErfP70459 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ErfP70459 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ErfP70459 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ErfP70459 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ErfP70459 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ErfP70459 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ErfP70459 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ErfP70459 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ErfP70459 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ErfP70459 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ErfP70459 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ErfP70459 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms