Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9xP70398 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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