Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx3P70354 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx3P70354 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msx3P70354 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Msx3P70354 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msx3P70354 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms