Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pitx1P70314 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pitx1P70314 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms