Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp7P70280 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp7P70280 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms