Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdlim4P70271 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim4P70271 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms